明朝中央機(jī)構(gòu)最主要的改革是廢除中書(shū)省和丞相。1376年，朱元璋借胡惟庸案，廢除中書(shū)省和丞相，六部成為最高行政機(jī)構(gòu)，各部最高長(zhǎng)官是尚書(shū)，另設(shè)左右侍郎各1人。這一重大政治變化，使權(quán)力直接集中于皇帝，秦漢以來(lái)實(shí)行了1000多年的宰相制度廢除，皇帝的權(quán)力更大了。御史臺(tái)為朝廷的監(jiān)察機(jī)構(gòu)，最高長(zhǎng)官為御史大夫，后來(lái)改為都察院，長(zhǎng)官叫御史，其主要職能是糾察彈劾百官。都察院下設(shè)13道監(jiān)察御史，糾察內(nèi)外官員，明朝御史等官的品秩較低，但由于地位特殊，極受重視，對(duì)百官有威懾作用。另外，刑部主審訊，大理司復(fù)審和駁正。都察院、刑部、大理司合稱“三司法”,三司法不能決者送請(qǐng)皇帝決斷。
地方政權(quán)廢除行中書(shū)省，在全國(guó)設(shè)置13個(gè)承宣布政使司，左、右布政使為布政使司最高長(zhǎng)官，掌管全省民政、財(cái)政事務(wù)；另設(shè)提刑按察使司，掌管全省刑法，按察使司設(shè)按察使、按察副使等；都指揮使司掌管全省軍隊(duì)。布政使司、按察使司、都指揮使司是三個(gè)互相單行的機(jī)構(gòu)，三者合稱“三司”,互不統(tǒng)屬。布政使司隸屬于吏部和戶部，按察使司隸屬于都察院和刑部，都指揮使司則隸屬于五軍都督府和兵部。布政使司下設(shè)府、州、縣，分別置知府、知州、知縣。