進(jìn)入新石器時(shí)代的云南文化，呈現(xiàn)出五光十色的景象。迄今已在云南三十多個(gè)縣市的一百多個(gè)地方發(fā)現(xiàn)了新石器時(shí)代文化遺址和墓葬，而且由于復(fù)雜的地理?xiàng)l件，使得這些新石器文化呈現(xiàn)出復(fù)雜的多樣性、以至幾乎每處所發(fā)現(xiàn)的文化遺存都自成體系、各有自己的特點(diǎn)，形成獨(dú)具特色的文化類型，目前考古學(xué)界把云南的文化遺址分為六大區(qū)域，六種文化類型：白羊村文化、大墩子文化、滇池區(qū)域文化、瀾滄江中上游地區(qū)文化、滇東北文化、滇東南文化。
五光十色的云南新石器文化，各文化類型既有自己的特點(diǎn)、彼此之間又有一定的聯(lián)系，如以劃紋和壓印紋為主的陶器、呈梯形的扁圓柱形石斧、幾乎是洱海、滇池、金沙江中游三個(gè)地區(qū)的共同現(xiàn)象，而云南新石器文化同內(nèi)地以及鄰近地區(qū)新石器文化也有一些聯(lián)系。如元謀大墩子和賓川白羊村的長(zhǎng)方形地面式建筑的房屋模式，結(jié)構(gòu)與黃河流域新石器文化的同類文化遺址完全相同；在仰韶文化、中原諸龍山文化住房遺址周圍大量發(fā)現(xiàn)的甕棺葬，在云南的新石器文化遺址中也可以見到；起源于山東龍山文化的收割工具半月形穿孔石刀和源于江西、浙江地區(qū)的多孔石刀在洱海地區(qū)皆有發(fā)現(xiàn)。源于長(zhǎng)江下游的有段石錛、源于珠江三角洲的有肩石斧以及交匯后產(chǎn)生的有肩有段石錛卻成為洱海區(qū)域、滇池區(qū)域、滇東北以及瀾滄江中上游文化類型的共同現(xiàn)象。這些方方面面的共性反映出盡管云南境內(nèi)高山谷深、河流湍急、遠(yuǎn)古居民被分割成一個(gè)個(gè)小部落，但云南文化還是受到了以黃河中游為中心的西北內(nèi)陸文化和以珠江、長(zhǎng)江中下游為中心的東南沿海文化的影響，這說明云南文化一開始就不是孤立發(fā)展的。