孫中山和大多數(shù)的國民黨人，對于袁世凱死后代之而起的段祺瑞封建軍閥專制的本質(zhì)，在一個相當(dāng)長的時期內(nèi)是認(rèn)識不清的。袁世凱病亡次日，孫中山在上海向報界發(fā)表談話說：“對于今日之時局，頗具樂觀?！艚窈竽媳备鲌?zhí)權(quán)者能一秉至公，尊重約法，擁護(hù)共和，去其爭位奪權(quán)之私心，革其武人干政之惡習(xí)，以愛國之真誠、和平之精神，致力于奠定國基、建設(shè)國政之事業(yè)，則袁死而中國真可大治?！?sup>[1]孫中山抱著息事寧人的態(tài)度，曾多次表示他能夠與段合作。6月中旬，孫中山公開在上海發(fā)表談話說：段祺瑞“曾為逆黨所不容，此時或能與民軍相互提攜，亦未可料”^[2]。他對段祺瑞雖然也有些擔(dān)心，但主要是對段身邊的袁世凱的一些舊人不信任，怕段為“莠言所惑，重陷天下于紛糾”;而對段本人則表現(xiàn)出明顯的好感，一再稱頌段“扶危定傾，經(jīng)武圖強”,為北洋將領(lǐng)中的精粹。
孫中山為了表達(dá)愿與段祺瑞合作的誠意，特派中華革命黨人蕭萱和葉夏聲到北京，征詢段對處理反袁戰(zhàn)爭善后問題的意見，并主動提出收束中華革命黨的軍隊。與此同時，孫中山電令國內(nèi)各地的中華革命軍罷兵息戰(zhàn)，實現(xiàn)國內(nèi)和平，一切俟法律解決。6月10日，孫中山分別致電朱執(zhí)信和居正說：“袁死政局一變，我宜按兵勿動，候商黎大總統(tǒng)解決?！?sup>[3]6月13日又致電黃興，“黎能復(fù)約法，召集國會，當(dāng)息紛爭、事建設(shè)以昭信義、固國本?！?sup>[4]他還在給各地中華革命軍將領(lǐng)的電文中說：“今者袁死黎繼，我輩革命之目的物不存，則革命軍亦無從繼續(xù)?！?sup>[5]他認(rèn)為在新的形勢下，中華革命黨不應(yīng)以軍事爭政權(quán)，而應(yīng)順應(yīng)國民心理，對贊成共和的執(zhí)政者“暫為監(jiān)視”^[6]。當(dāng)時，中華革命黨在國內(nèi)的力量雖不很大，但分布還是比較廣的，山東、廣東、福建、四川等地都有中華革命軍的組織，其中在山東的中華革命軍東北軍有一定實力，已組織起二師一旅的正規(guī)軍。對于孫中山立即結(jié)束軍事行動并解散革命軍的意見，當(dāng)時中華革命軍將領(lǐng)和一些志愿從軍反袁的華僑是持有異議的，但孫中山力排眾議，一再發(fā)出立即收束的命令。對少數(shù)抵觸情緒較大的中華革命軍將領(lǐng)，孫中山甚至采取了強硬的態(tài)度。他曾電告在山東的中華革命軍東北軍總司令居正說：“各軍如不依令解散，即脫離關(guān)系?！睂θA僑戰(zhàn)士，孫中山則反復(fù)勸諭說：“假如今日軍隊不解散，其數(shù)不過十萬，華僑隊不過千數(shù)百人，其力未必能謂之無敵。惟以心力護(hù)此共和，則效力遠(yuǎn)勝于武力?！?sup>[7]
中華革命黨經(jīng)費，絕大部分來自海外華僑捐款。護(hù)國戰(zhàn)爭結(jié)束，華僑捐款也告終止。這也是孫中山不得不取消中華革命軍的一個原因。
在孫中山的督促下，居正等于8月上旬赴濟南，與山東督軍張懷芝和北京政府的代表商定編遣中華革命軍東北軍事宜。12月，中華革命軍東北軍在濰縣、高密、昌東等地交槍，由北京政府和山東督軍派人編遣。在此前后，廣東、四川、福建的中華革命軍也都結(jié)束了軍事行動，并相繼解散。在孫中山“息戰(zhàn)爭，事建設(shè)”的思想指導(dǎo)下，中華革命黨人在反袁戰(zhàn)爭中組織起來的一點武裝，就這樣完全收束了。
這時，不僅中華革命軍完全收束，就是中華革命黨組織本身，也宣布停止活動。7月，中華革命黨本部向各地支、分部發(fā)出通告，宣布奉總理指示，不僅收束軍事，“一切黨務(wù)亦應(yīng)停止”^[8]。
不論是收束武裝，還是停止政黨活動，孫中山的指導(dǎo)思想的基本點都在于從事和平建設(shè)。他認(rèn)為北京政府宣布恢復(fù)《臨時約法》和國會后，“執(zhí)政者已贊成共和”,中國國內(nèi)已具備了從事和平建設(shè)的環(huán)境?！捌茐募冉K，建設(shè)方始”^[9]。
為了向國人說明自己從事和平建設(shè)的決心，孫中山還表示將不問政事。他在給友人的一封信中說：“今后想無有野心家矣。則維持現(xiàn)狀，以使政理從漸而進(jìn)，國內(nèi)大有人矣。”他本人決意從此不再過問國事^[10]。
當(dāng)然，孫中山解散中華革命黨本部組織，表示不想過問政事，也還有一些策略上的考慮。袁世凱死后，基于廣大群眾厭倦政黨政治的心理，社會輿論普遍地批評政黨。而進(jìn)步黨人和國民黨穩(wěn)健派也都標(biāo)榜“不黨主義”,以適應(yīng)輿論和群眾心理。孫中山和中華革命黨人為了爭取群眾，也必須有所表示，這也是他表示不問政事的原因之一。
在袁世凱死后的相當(dāng)一段時間內(nèi)，孫中山對用和平方法來改善政治抱有很大的期望。北京政府宣布恢復(fù)《臨時約法》和國會后，孫中山多次鼓勵在上海的國民黨議員北上，以便組織一個好國會，制定一部好憲法。孫中山為了表示和北京政府合作的誠意，還改變了民國初年拒絕袁世凱授予大勛位的做法，接受了黎元洪頒授的大勛位，并于1917年1月在上海寓所舉行了正式接受大勛位的儀式。在孫中山的影響下，中華革命黨人的議員田桐等也相繼宣布，要“移武力革命精神，趨入政治軌道”^[11]。
1916年8月1日國會復(fù)會后，國民黨人(無論是中華革命黨，還是穩(wěn)健派)都以國會為進(jìn)行政治活動的主要陣地。孫中山雖不在北京任職，但對國會也抱有很大期望。他一向把憲法和國會看作實現(xiàn)民主共和的根本途徑。反袁戰(zhàn)爭結(jié)束后，孫中山曾總結(jié)袁世凱背叛民國的教訓(xùn)，指出：袁世凱之所以能夠?qū)嵭蟹饨▽Ｖ?，?fù)辟帝制，最根本的原因是“民智未開”,人民未能行使主權(quán)。因此，他認(rèn)為：維護(hù)民主共和必須使民眾參政，而使民眾過問政治的最好方法是實行地方自治，漸次實現(xiàn)直接民權(quán)。7月中旬，孫中山在歡送國會議員北上的茶話會上，第一次向各界公開提出以“地方自治為建國基礎(chǔ)”的政治主張。7月下旬至8月中旬，孫中山游歷杭州、紹興、寧波等地，行蹤所至，無不發(fā)表講演，鼓吹地方自治和直接民權(quán)。孫中山這時所找到的救國方案，仍是以美國為模式的資產(chǎn)階級政治制度。他認(rèn)為，學(xué)習(xí)美國、瑞士等國家實行地方自治的制度，便能建設(shè)真正的共和，使民國名實相符。
9月，國會開始審議憲法草案，一部分議員即在孫中山的影響下，提出將地方制度加入憲法的修改憲法提案。但是，段祺瑞實行的仍是軍閥獨裁專制，他根本不想實行真正的民主共和，從來沒有把憲法和國會放在眼中，也根本不可能采納孫中山等提出的所謂“地方自治”的方案。不久，事實就告訴了孫中山，他的“地方自治”的設(shè)想，只能在國會中引起無休止的爭論而得不到任何結(jié)果；即使“地方自治”的條文被列入憲法，也只能是一紙空文。因為當(dāng)時的中國沒有實行資產(chǎn)階級民主制度的條件，任何中央集權(quán)，只能是中央封建專制；地方自治，也只能是地方軍閥的割據(jù)和專制。