伊斯蘭教，又名回教，是阿拉伯半島麥加人穆罕默德于公元7世紀(jì)初創(chuàng)立的一神教?！鞍怖笔撬奈ㄒ簧瘢磐椒Q為“穆斯林”,主要經(jīng)典是《古蘭經(jīng)》。伊斯蘭為和平、順從之意。同世界幾大宗教相比，它是后起的宗教，但由于它傳播地區(qū)廣，信徒多，影響大，從而與佛教、基督教并稱為世界三大宗教。到公元10世紀(jì)中葉，隨著阿拉伯帝國(guó)勢(shì)力的東進(jìn)，伊斯蘭教開(kāi)始在新疆得到了傳播，并為喀喇汗王朝逐漸接受。據(jù)已失傳的《喀什噶爾史》(部分保留在賈馬勒·喀爾西的《蘇拉赫詞典補(bǔ)編》中)記載，喀喇汗王朝接受伊斯蘭教的第一位首領(lǐng)是薩圖克·布格拉汗(?—955)。對(duì)于他信仰伊斯蘭教的經(jīng)過(guò)，民間有多種傳說(shuō)。有的說(shuō)，他一次出外打獵，途中遇到一批穆斯林商隊(duì)正作禮拜。他們對(duì)安拉的虔誠(chéng)，使他肅然起敬。從此他就皈依伊斯蘭教了。還有的說(shuō)，一天夜里，他夢(mèng)見(jiàn)一神仙下凡對(duì)他說(shuō)：“為了拯救自己的今世和來(lái)世，你要皈依伊斯蘭教?！彼阈欧盍恕＿@些傳說(shuō)帶有濃厚的傳奇色彩。其實(shí)伊斯蘭教當(dāng)時(shí)已在民間傳播，形成了一股新的勢(shì)力，薩圖克·布格拉什是懷有政治抱負(fù)才接受伊斯蘭教的。后來(lái)，他的子嗣也都是伊斯蘭教虔誠(chéng)的信仰者。他們把伊斯蘭教奉為喀喇汗王朝的國(guó)教，而且經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期的宗教戰(zhàn)爭(zhēng)，使和田地區(qū)約于11世紀(jì)前后也被迫接受了伊斯蘭教。據(jù)穆斯林史家米爾扎·海答爾《拉史德史》記述，察合臺(tái)汗國(guó)的禿魯黑·帖木兒在14世紀(jì)中葉信仰了伊斯蘭教，成為新疆地區(qū)第一個(gè)入教的蒙古汗。據(jù)傳，在他統(tǒng)治時(shí)期(1346—1363),新疆有十六萬(wàn)蒙古人皈依了伊斯蘭教。15世紀(jì)初，察合臺(tái)汗國(guó)穆罕默德汗統(tǒng)治時(shí)期，新疆當(dāng)時(shí)的蒙古人全部信仰了伊斯蘭教。這部分蒙古人成為穆斯林后，逐漸維吾爾化，并且最后融于維吾爾族中。15世紀(jì)末至16世紀(jì)初，伊斯蘭教最后在吐魯番和哈密地區(qū)取得優(yōu)勢(shì)。自此，全疆各地伊斯蘭教取代了佛教，成為在新疆占統(tǒng)治地位的宗教。它之所以能在新疆扎根，并取得統(tǒng)治地位，與當(dāng)時(shí)新疆的自然地理?xiàng)l件、經(jīng)濟(jì)制度同產(chǎn)生此教的阿拉伯地區(qū)有許多相似之處分不開(kāi)。
伊斯蘭教在世界上的廣泛傳播，使得伊斯蘭文化在吸取了當(dāng)時(shí)世界上許多高度發(fā)展的文化優(yōu)點(diǎn)之后，更加迅速地發(fā)展起來(lái)，成為中世紀(jì)史上一朵盛開(kāi)的鮮花。自創(chuàng)建喀喇汗王朝的回鶻人接受伊斯蘭教，至今已達(dá)千年。今天，占全疆總?cè)丝诎俜种笥业氖畟€(gè)民族全民信仰伊斯蘭教。在長(zhǎng)期的歷史過(guò)程中，由《古蘭經(jīng)》確定下來(lái)的伊斯蘭教的教義、教規(guī)、教法以及婚姻、喪葬等制度，完全滲透到信仰伊斯蘭教各民族文化之中。它們與本民族的一些傳統(tǒng)文化融為一體，創(chuàng)造了新疆的伊斯蘭文化。新疆的伊斯蘭文化是天山文化極為重要的組成部分。
伊斯蘭教認(rèn)為，《古蘭經(jīng)》是安拉用阿拉伯語(yǔ)下降的“天啟”,于是阿拉伯語(yǔ)和書(shū)寫(xiě)《古蘭經(jīng)》的阿拉伯文就變成了“神圣”的語(yǔ)言文字，任何國(guó)家和地方的穆斯林都必須用阿拉伯語(yǔ)文誦讀和書(shū)寫(xiě)《古蘭經(jīng)》經(jīng)文。16世紀(jì)前，世界上只有阿拉伯文的《古蘭經(jīng)》傳世。后來(lái)各地雖相繼出現(xiàn)其他文本的《古蘭經(jīng)》,但誦讀時(shí)仍只能用阿拉伯語(yǔ)，直到今天依舊如此。隨著伊斯蘭教的傳入，阿拉伯語(yǔ)言和文字開(kāi)始在新疆流行。目前已發(fā)現(xiàn)的喀喇汗王朝時(shí)期的葉爾羌公函、文件，都是古回鶻文和阿拉伯文并用的。用阿拉伯文寫(xiě)作變成了一時(shí)的風(fēng)尚。像11世紀(jì)的維吾爾族名著《突厥語(yǔ)大辭典》中的古代突厥語(yǔ)詞條及民歌、格言、諺語(yǔ)等，就是用阿拉伯字母寫(xiě)成的。同一時(shí)期的另一名著《福樂(lè)智慧》,有人認(rèn)為作者先用阿拉伯字母寫(xiě)成，然后才有回鶻文抄本的。16世紀(jì)后，阿拉伯字母的維吾爾文已成為全疆各地維吾爾人統(tǒng)一使用的文字。
阿拉伯式或中亞式尖拱形洞式門(mén)窗、穹窿形大圓屋頂一類的伊斯蘭教建筑，在新疆各地隨處可見(jiàn)。它們有的是清真寺、麻扎(墓墳)等宗教建筑，有的是一些民用建筑。伊斯蘭教特別重視作禮拜，隨著伊斯蘭教成為新疆占統(tǒng)治地位的宗教后，作禮拜用的清真寺建筑也隨之遍及天山南北。新疆的清真寺有三種：每日作五次禮拜用的普通清真寺、作星期五(主麻日)正午“主麻拜”用的加曼清真寺和節(jié)日時(shí)作禮拜和活動(dòng)用的艾提尕清真寺。艾提尕清真寺一般坐落在穆斯林比較集中的大城鎮(zhèn)，它的地位使之自然成為當(dāng)?shù)氐淖诮袒顒?dòng)中心。在伊斯蘭教徒心目中，清真寺即神靈之家，所以他們不惜財(cái)力物力，竭盡其建筑技藝。一些艾提尕清真寺建筑水平非常高，往往成為本民族或本地區(qū)建筑藝術(shù)的集中體現(xiàn)和代表。這類清真寺中最著名的要屬于喀什市中心的艾提尕清真寺。
喀什艾提尕清真寺是中國(guó)最大的一座清真寺。它以其悠久的歷史、雄偉的建筑和莊嚴(yán)肅穆的色彩等特點(diǎn)聞名中外，吸引著成千上萬(wàn)來(lái)自國(guó)內(nèi)外的穆斯林和其他游客。它是我國(guó)古代維吾爾民族創(chuàng)建的歷史瑰寶之一，已列為新疆維吾爾自治區(qū)的重點(diǎn)文物保護(hù)單位。這個(gè)大寺從建寺至今，已有五百多年歷史。它屢經(jīng)修建和擴(kuò)展，才具有今天這樣宏大的規(guī)模。全寺總面積一萬(wàn)六千八百平方米，由禮拜堂、教經(jīng)堂、門(mén)樓和其他一些附屬建筑物組成。大門(mén)樓高約十二米，它的兩邊各豎有一個(gè)十八米高的尖塔，樓頂立有一彎象征伊斯蘭教的新月。進(jìn)入大門(mén)是一個(gè)大庭園，院內(nèi)有花木和水池。東南北三面建有經(jīng)文學(xué)校、神職人員的住房等。禮拜大殿是寺院的主體，呈長(zhǎng)方形，分為內(nèi)殿、外殿和長(zhǎng)廊三部分，總面積為兩千六百多平方米。大殿頂部由一百五十八根淺藍(lán)色的立柱托著，成方格狀。立柱四角為幾何圖形，上面刻有民族風(fēng)格的凸形花紋。整個(gè)建筑融阿拉伯與維吾爾族建筑風(fēng)格于一體，呈現(xiàn)出獨(dú)特的民族特色。