楊嗣昌任督師時(shí)，曾私下許諾讓賀人龍接替左良玉的平賊將軍職務(wù)。后來這一許諾沒有能兌現(xiàn)，賀人龍?jiān)购迼钏貌谑且卜滦ё罅加?，不聽楊嗣昌的調(diào)遣。幾年后，丁啟睿接替楊嗣昌的職務(wù)。崇禎十四年(公元1641年)九月，總督傅宗龍率賀人龍、李國奇部隊(duì)出潼關(guān)(故治所在今陜西潼關(guān)東南),與農(nóng)民軍相遇于孟家莊。戰(zhàn)斗剛開始，賀人龍就率所屬部隊(duì)逃走，李國奇苦戰(zhàn)不勝，也敗走，致使總督傅宗龍陣亡。崇禎十五年(公元1642年)正月，總督汪喬年率賀人龍等部隊(duì)圍剿農(nóng)民軍，在襄城(故治在今河南方城境內(nèi))與農(nóng)民軍接火交戰(zhàn)。賀人龍又不戰(zhàn)而退，使汪喬年陣亡。賀人龍的行為使崇禎皇帝大怒。崇禎皇帝想將他斬首，但又怕引起兵變，只是免去其職務(wù)，令他戴罪帶兵。孫傳庭到陜西督師時(shí)，崇禎皇帝授意他斬殺賀人龍。這時(shí)賀人龍率部隊(duì)駐在咸陽(故治所在今陜西咸陽東13里),猜測(cè)到朝廷要懲罰他，命令部隊(duì)日夜防備。孫傳庭考慮到賀人龍是米脂(今屬陜西)人，其親族中有許多人在農(nóng)民軍中，所以不能輕易動(dòng)手。因而他在給皇帝的上疏中假裝說：“賀人龍是臣的老部下，請(qǐng)求赦免其罪，使他跟隨臣為國效勞?！被实壑缹O傳庭的用意，于是下詔同意孫傳庭的請(qǐng)求。賀人龍到這時(shí)心里才稍為安靜了一些，戒心也少了許多。孫傳庭與陜西巡撫張爾忠密謀除賀人龍的計(jì)劃，決定以五月初一召賀人龍來巡按處議事為名，誘他來巡撫大帳，將他斬首。賀人龍果然中計(jì)被殺。賀人龍被殺后，其部將周國卿率精兵200與同黨魏大亨、賀國賢、高進(jìn)庫等逃回涇陽(故治所在今陜西省涇陽東南30里),取妻子兒女，然后投奔農(nóng)民軍。張爾忠早就預(yù)料到了這一點(diǎn)，他派參將孫守法搶先趕到?jīng)荜?，將賀人龍部將的妻室全部抓住，做為人質(zhì)。周國卿趕到?jīng)荜枙r(shí)，見到妻兒子女在官軍手中，無計(jì)可施，于是向?qū)O守法說，他去將魏大亨等人殺掉，投降官軍。張爾忠將這一消息秘密地告訴了魏大亨。魏大怒，設(shè)計(jì)將周國卿殺死，將其首級(jí)送給官軍。周國卿等人兵變就這樣平定了。賀人龍的其他部將高杰、高汝利、賀勇等14人仍官居原職。經(jīng)過這樣分化處理，賀人龍被殺后，其部隊(duì)也未發(fā)生嘩變。