從現(xiàn)有的材料分析，在漢族移民入臺(tái)之前，大陸上已有兩次向臺(tái)灣移民，或經(jīng)過(guò)福建或直接從福建移入。
第一次遷入臺(tái)地的是左鎮(zhèn)人和長(zhǎng)濱文化的主人，他們生活于舊石器時(shí)代的晚期，為北京人的后裔，大體于地球上最后一次冰期時(shí)向南遷，在距今一萬(wàn)年至三萬(wàn)年前通過(guò)閩臺(tái)間的大陸架即今天的臺(tái)灣海峽進(jìn)入臺(tái)灣地區(qū)。左鎮(zhèn)人和長(zhǎng)濱文化的主人，并不是長(zhǎng)途跋涉直接從北方進(jìn)入臺(tái)地，而是從北方南遷后在福建地區(qū)生活了相當(dāng)長(zhǎng)的時(shí)間后才移進(jìn)臺(tái)地的。不久前，福建考古工作者在閩南東山島發(fā)現(xiàn)了舊石器時(shí)代晚期的一塊人類右側(cè)肱骨殘斷化石，稱東山人化石，時(shí)間約距今一萬(wàn)年左右。這可證明，舊石器時(shí)代東山已有人居住了。1988年5月福建考古工作者在閩西清流沙芙洞口村的狐貍洞里，發(fā)現(xiàn)距今一萬(wàn)年前的更新世晚期清流一帶已有人類活動(dòng)了。無(wú)疑，這些清流人和東山人都是從北方遷來(lái)的。這些舊石器時(shí)代的左鎮(zhèn)人以及長(zhǎng)濱文化主人、東山人、清流人，同是北京人的后裔，有共同的血統(tǒng)，他們移動(dòng)路線是華北——清流——東山——臺(tái)灣。這樣，人們看到，臺(tái)灣早期人類與福建早期人類，有著血統(tǒng)的關(guān)系。臺(tái)灣歷史上曾有過(guò)飛人、雞距人、小黑人，后來(lái)不見(jiàn)了。有人認(rèn)為，那些人有可能是左鎮(zhèn)人、長(zhǎng)濱文化主人的后裔，后來(lái)因?yàn)椴贿m應(yīng)環(huán)境變化而被淘汰掉。也有人認(rèn)為，他們屬于尼格利佗種人，來(lái)自菲律賓，除一小部分與南亞蒙古人混合以外，都在激烈的種族戰(zhàn)爭(zhēng)中被消滅了。
第二次遷入臺(tái)灣的大陸居民，是現(xiàn)在還生活在臺(tái)灣的土著民族即高山族(也稱山地同胞)的祖先，他們是在臺(tái)灣成為海島之后到臺(tái)地的，其最早遷入者約在距今6500年前，最遲者約在2000年至2500年前。他們?cè)跉v史上被稱為“東鳀”人、“夷洲”人、“流求”人和“東番”人等，晚近也有人稱之為“番族”(包括“生番”、“野番”和“熟番”),那是多帶有貶意的稱呼。高山族不是統(tǒng)一的民族，而是由幾個(gè)部分組成的，其語(yǔ)言、生活習(xí)慣等都不相同。如今高山族主要生活于臺(tái)灣的山區(qū)。
臺(tái)灣的高山族，約有四十多萬(wàn)人，差不多占本省總?cè)藬?shù)的百分之二。高山族是比漢族更早來(lái)到臺(tái)灣的民族，經(jīng)過(guò)長(zhǎng)期的歷史發(fā)展，已演化為兩部分：一部分定居在平地上年代較久的并與漢族融合者稱為平埔族。平埔族乃統(tǒng)稱，由好幾個(gè)部分組成：凱達(dá)格蘭人(分布于基隆、淡水一帶),噶瑪蘭人(分布于宜蘭一帶),道卡斯人(分布于新竹、苗栗一帶),巴宰海人(分布于臺(tái)中),巴布拉人(分布于大甲溪和大安溪之間),西拉雅人(分布于臺(tái)南、高雄、屏東一帶),水沙連人(或稱為邵人，分布于日月潭附近),巴布薩人(分布于彰化大肚溪以南),安雅人(分布于嘉義和南投一帶)以及雷郎人等，住山區(qū)的稱山地同胞，住平地的稱平地山胞，人口約十萬(wàn)左右，現(xiàn)已和漢族人很難區(qū)別。另一部分是受漢族影響較小，迄今多數(shù)仍居住在山區(qū)，并且保持著本民族原有習(xí)俗和語(yǔ)言者，稱高山族，人口約三十三萬(wàn)左右。現(xiàn)時(shí)臺(tái)灣的高山族，主要是指后面這部分，按他們的種族和文化特征是屬于蒙古人種的一個(gè)分支，明清時(shí)稱“番族”,在日本統(tǒng)治時(shí)期稱為高砂族。1945年臺(tái)灣光復(fù)后才改稱高山族。高山族按不同的習(xí)俗和語(yǔ)言，實(shí)際上可分為九個(gè)部分(或稱九個(gè)族群):泰雅人，7.6萬(wàn)多人，居臺(tái)灣中部，分布在埔里以北的山區(qū)，有人稱之為高山族的代表；布農(nóng)人，3.5萬(wàn)多人，居住于中央山脈偏東之最高山地，分布在關(guān)山和玉里一帶；曹人(也稱朱歐人),7100人，居住于玉山以西的阿里山一帶；賽夏人，約3900人，居住于阿里山和五峰山一帶；魯凱人，約6300人，分布在阿里山以南大武山以北地區(qū)；排灣人，6萬(wàn)多人，與漢族接觸最早，居住于大武山以南到恒春一帶；卑南人，約8000多人，居于卑南溪以南，知本溪以北的海岸地區(qū)；阿美人，約12萬(wàn)人，是高山族人口最多的一部分，居住于臺(tái)東縱谷地帶，即花蓮和臺(tái)東一帶，多數(shù)在平地，文化程度較高；雅美人，約3500人，居于蘭嶼島，同外界接觸較少，多從事漁業(yè)為生。高山族大多居住在貧瘠、偏僻的山區(qū)，經(jīng)濟(jì)、文化較落后，但因所處的具體環(huán)境和外界影響的不同，各部族間的發(fā)展水平也不盡相同，其中排灣族已進(jìn)入了封建貴族世襲制社會(huì)；而其他各族均不同程度保留著氏族制度的某些特征，過(guò)著半耕半獵的生活。幾十年來(lái)，隨著社會(huì)經(jīng)濟(jì)的發(fā)展，高山族正在逐漸地漢化，跳躍式地發(fā)展。
不同部分的高山族遷臺(tái)灣來(lái)自的方向和時(shí)間不盡相同。不過(guò)，他們中的一部分來(lái)自福建一帶的閩越族即福建的土著族是可以肯定的。人們從臺(tái)灣考古發(fā)掘的遺物，即近幾年從臺(tái)灣各地發(fā)掘出土的各種陶器中看到，它的形狀及制作方法，都與往日在大陸各地發(fā)掘的極為相似，那可認(rèn)為是大陸文化對(duì)臺(tái)灣的延伸。
關(guān)于高山族的來(lái)源，陳碧笙先生在《臺(tái)灣地方史》一書(shū)中，提出一條線索。他說(shuō)，現(xiàn)在的臺(tái)灣土著居民，不論是屬于北部山居人(舊史所謂“生番”,“野番”),或者南部沿岸平埔人(所謂“熟番”或“平埔番”),大部分都是屬于南亞蒙古人種的原馬來(lái)亞人的后裔。原馬來(lái)亞人的祖先最初發(fā)源于亞洲北部大陸，一支沿東部海岸南下，廣泛分布于我國(guó)東南部沿南地區(qū)，古代叫百越(有于越、揚(yáng)越、東甌、閩越、南越等);另一支越長(zhǎng)江上流南下，分布于五嶺以西的西南峽谷地區(qū)，叫百濮。大概在新石器時(shí)代的中期或晚期，有一支越族自我國(guó)東南沿海分?jǐn)?shù)批渡海到了臺(tái)灣，一部分留下來(lái)與先住在那里的矮黑人相融合，后來(lái)大概就成為泰雅、賽夏、布農(nóng)、朱歐等人的祖先；又一部分繼續(xù)南移到菲律賓、加里曼丹、蘇拉威西諸島，也與當(dāng)?shù)氐哪岣窭⒎N人相融合，成為原馬來(lái)人的某些支系。有段石錛很可能就是古越族制造、使用并傳播到臺(tái)灣及南洋諸島去的，大約在同一時(shí)期，有幾支越人和濮人也分作若干批到南洋群島，與古印度奈西安種人相融合，成為原馬來(lái)人，大部分馬來(lái)人留下與原住那里的尼格利佗種人相融合，成為后來(lái)的真馬來(lái)人，沒(méi)有同尼格利佗人融合的部分，后來(lái)有一支經(jīng)由菲律賓移入臺(tái)灣，這些人大概就是排灣、阿美、卑南、雅美和平埔等人的祖先。這樣，從大陸出發(fā)的兩支南亞蒙古人種，最后仍在臺(tái)灣匯合，北部泰雅人、賽夏人、布農(nóng)人、朱歐人的祖先應(yīng)是最早到達(dá)臺(tái)灣的，他們來(lái)自大陸，所以至今仍保持古越、濮諸族的一些文化特征，如缺齒、去毛、紋身、黥面、獵首、吹口琴、著貫頭衣、住干欄屋、行崖葬及室內(nèi)葬，腰機(jī)紡織以及父子連名等。在南部，排灣人到達(dá)最早，以大武山為發(fā)祥地，最初住在平地上，后因敵不過(guò)文化比較先進(jìn)的平埔人才退入山地。平埔人大概于1500至1600年前遷入臺(tái)灣，占據(jù)西部、西北部和東北部沿海地區(qū)。卑南人、阿美人也相繼而來(lái)，占據(jù)東部。雅美人來(lái)得晚，于公元6至8世紀(jì)間遷入紅頭嶼。
中國(guó)古代有“閩在海中”之說(shuō)，那是指閩越族在海島中。閩即閩越族。閩越在歷史上雖有“閩”和“越”的不同稱呼，實(shí)是同一的，初時(shí)閩為族名，越為國(guó)名，后來(lái)合而為一了，成了閩越族(百越族的一個(gè)支系),因?yàn)樗麄兊幕顒?dòng)地區(qū)分布于我國(guó)東南沿海，所以后來(lái)泛指沿海地區(qū)的土著民族，最后則成了福建古代土著民族的專稱。人們可以這么說(shuō)，閩即越，即蠻、即番。臺(tái)灣土著民族曾被稱為“番族”,自是與此有關(guān)，因?yàn)榕_(tái)灣的土著民族有的系來(lái)自大陸，來(lái)自福建的土著族即閩越族，所以一直保留著大陸古代的一些神話傳說(shuō)，如泰雅人、布農(nóng)人的“征日”傳說(shuō)，即把天上多余的日打下來(lái)的傳說(shuō)，那無(wú)疑是來(lái)自后羿射日的神話；有的一直保留著閩越族的崇蛇習(xí)俗；有的在住房建筑方面仍和古代閩越族的形式一樣，等等。這些也都證明，臺(tái)灣土著族與福建土著族即閩越族有血緣的關(guān)系。
從史籍記載看，早在先秦以前，臺(tái)灣曾是越國(guó)的勢(shì)力范圍，由于這種關(guān)系，遷居臺(tái)灣的閩越人，與大陸的越國(guó)人時(shí)有往來(lái)。后來(lái)又為什么不來(lái)往了呢？主要因?yàn)榇箨憣?shí)行海禁政策，特別是由于秦始皇、漢武帝等封建統(tǒng)治者多次下令遷徙沿海越人到內(nèi)地，其結(jié)果必然使臺(tái)灣與大陸相隔離。此后兩地同胞也就失去了聯(lián)系，到了三國(guó)時(shí)，吳國(guó)統(tǒng)治者試圖再恢復(fù)先秦時(shí)與臺(tái)灣的那種關(guān)系和聯(lián)系，為此，便有黃龍二年(230)征夷州的事發(fā)生。這次吳國(guó)統(tǒng)治者派衛(wèi)溫、諸葛直率將士萬(wàn)人渡海，攻打夷州，可惜沒(méi)有成功，反使士卒死了十之八九。這是一次得不償失的舉動(dòng)，統(tǒng)帥衛(wèi)溫、諸葛直因此坐牢、殺頭。吳國(guó)人沈瑩可能當(dāng)年參加過(guò)這場(chǎng)出征作戰(zhàn)，后來(lái)年老時(shí)根據(jù)回憶，寫(xiě)成了《臨海水土志》一書(shū)，介紹當(dāng)時(shí)夷州的許多情況。從《臨海水土志》一書(shū)中，人們不難看出，當(dāng)時(shí)的夷州除了今日的臺(tái)灣，不可能有別的地方。那里所描寫(xiě)的“山夷”人即夷州居民的風(fēng)俗民情，多與越人相同，這也不難證明，臺(tái)灣居民中至少有一部分與大陸越族人同屬于一個(gè)種族，也就是說(shuō)，他們是從大陸遷去的。
夷州到了隋代稱流求，《隋書(shū)》載，隋代的統(tǒng)治者隋煬帝曾三次派人到流求活動(dòng)。第一次掠人而返，第二次取布甲而返，最重要的是第三次于大業(yè)六年(610)發(fā)兵萬(wàn)余人打流求，去了一個(gè)多月，戰(zhàn)果是虜男女?dāng)?shù)千人而歸。這數(shù)千人可能是數(shù)百人之誤。他們把虜?shù)降娜税差D到什么地方呢？明末福建人何喬遠(yuǎn)在其《閩書(shū)》中明確講到，隋代掠琉球(流求)五千戶，居福清福廬山的化南、化北二里。有人對(duì)此作了考證，認(rèn)為五千戶當(dāng)為五十戶，二百多人。福廬山也叫郭廬山，福廬山的化南、化北，在今福清縣龍?zhí)锔浇Ｓ腥苏f(shuō)這是臺(tái)灣人民移居大陸之始。到了元朝大德元年(1297),福建省平章政事高興，派省都鎮(zhèn)撫張浩、福州新軍萬(wàn)戶張進(jìn)率軍隊(duì)到琉求(臺(tái)灣)察訪，帶回了一百三十多名土著族人，在福建住了一些時(shí)間，于第二年又將他們送回臺(tái)灣。可見(jiàn)，早期兩地還是有聯(lián)系的。歷史上閩臺(tái)兩地人民的來(lái)往，雖有間斷過(guò)，可沒(méi)有停止。這里人們不難看出臺(tái)灣土著族(高山族)與福建的淵源關(guān)系。