明天啟(公元1621—1627年)年間，魏忠賢為首的閹黨把持朝政，大興黨獄，迫害東林黨人。這時顧大章任禮部郎中、陜西副使。他不與閹黨同流合污，多次為東林黨人申辯冤屈，由之遭到魏忠賢等人的怨恨。后閹黨借汪文言一案株連顧大章，將他逮捕入獄，并污告他貪污4萬錢。顧大章被捕剛送進關他的那間牢房時，屋子中突然長出黃色的靈芝，光彩照人。等這間牢房中6個“犯人”全部進來后，靈芝恰好長成六瓣。他們中有人認為這是吉兆，顧大章仰天嘆息道：“靈芝，吉祥之物，而現(xiàn)在屈辱地長在牢房中，這預兆著我們不能幸免于一死?！焙髞硭麄?人果然全部被閹黨迫害死于獄中。