武漢廣大軍民對保衛(wèi)漢陽傾注了極大的熱情。漢陽失陷，革命黨人無不悲痛欲絕?！吧踔淋嚪蛑圩?，皆相視對泣”^[1]。當時，武昌城內(nèi)謠言繁興，人心惶惶，居民紛紛逃避，秩序相當混亂。孫武、張振武、劉公等人派出稽查隊，沿街巡邏，遇有造謠惑眾者，即行拿獲正法。革命黨人不僅要用很大的力量維持秩序，更為重要的是布置堅守武昌。
黃興既去，黎元洪便下令以萬廷獻繼任戰(zhàn)時總司令。萬廷獻曾任南京陸軍中學堂總辦，思想守舊，因此遭到革命黨人的反對。萬未敢就職。同時，楊開甲也辭去總參謀長職。11月28日，黎元洪在軍政府召集會議，討論堅守武昌和總司令人選問題，孫武、蔣翊武、吳兆麟、蔡濟民、劉公、范騰霄等均出席。當場決定：戰(zhàn)時總司令一職由蔣翊武護理，吳兆麟為總參謀長，姚金鏞為副總參謀長；司令部設于洪山寶通寺；將沿江劃分為三個防區(qū)，以竇秉鈞、何錫蕃、張廷輔分任司令；海軍在陽邏附近游弋，掩護武昌。與此同時，黎元洪于11月27日、28日分電獨立各省都督，說明武昌危在旦夕，要求各都督“迅拔老練之兵，攜帶槍彈”,“星夜來鄂援助”^[2]。各省回電均表示希望“堅守待援”,并紛紛派出援軍。此后，湖南、江西、廣西、江蘇、上海的援軍相繼到達，特別是趙恒惕率領(lǐng)的桂軍和李烈鈞率領(lǐng)的贛軍的到來，有力地加強了武昌的防御力量。但是，當各軍到來時，雙方業(yè)已簽訂停戰(zhàn)協(xié)定，開始南北議和。
馮國璋攻陷漢陽后，清廷傳諭嘉獎，賞給他二等男爵，本希望他繼續(xù)進攻，占領(lǐng)武昌。然而，當時全國已有十四省宣布獨立，張勛又從南京敗退，逃往徐州。北方近畿一帶，也是險象環(huán)生。而清軍兵力卻全被吸引在京漢鐵路一線，根本無法應付全國的革命形勢。袁世凱有見于此，他就繼續(xù)施展反革命兩面手法，對武昌方面又打又拉，重點放在拉的方面。
一方面，袁世凱讓清軍從龜山用重炮轟擊武昌，繼續(xù)對黎元洪施加壓力。黎元洪早有棄城出逃的打算，因被范騰霄、張振武、甘績熙等阻止，第一次沒有走成。12月1日正午，都督府正廳中彈起火，黎元洪就倉惶出城，逃往武昌下游九十里的葛店。那是一個小鎮(zhèn)，能停泊小型兵艦。黎元洪準備效法瑞澂，如果武昌失守，就攜帶六十萬兩銀子登艦逃走。逃往葛店的途中，黎元洪在王家店還給英、俄領(lǐng)事和袁世凱發(fā)信，要范騰霄“幸即送到，以解決局勢之倒懸”。事實上是告訴對方，他在等待招撫。
另一方面，袁世凱又通過帝國主義使團加緊進行停戰(zhàn)議和的活動。帝國主義看到清王朝難以支撐，就積極扶植袁世凱，把他作為新的代理人。英國駐華公使朱爾典聯(lián)絡北京各國使團，出面斡旋停戰(zhàn)，為袁世凱絞殺革命創(chuàng)造條件。11月30日，袁世凱致電馮國璋，告訴他英國出面調(diào)停，令新任漢口兵備道黃開文同漢口英國領(lǐng)事商辦。
就在黎元洪出逃的當天，英領(lǐng)事派英人盤恩由軍政府顧問孫發(fā)緒陪同，到武昌晤黎元洪，商談停戰(zhàn)。盤恩帶來了停戰(zhàn)條件，說武昌成日受炮火威脅，百姓恐慌，領(lǐng)事館已同清軍商議，建議停戰(zhàn)三日。只要同意停戰(zhàn)條件，在協(xié)定上蓋章，雙方就可停戰(zhàn)。停戰(zhàn)條件規(guī)定：從12月2日上午八時起至12月5日上午八時止停戰(zhàn)三日；在停戰(zhàn)期內(nèi)雙方一律按兵不動，“各守現(xiàn)據(jù)界限，彼此不得稍有侵犯窺探”^[3];雙方均由各國領(lǐng)事監(jiān)視。這時黎元洪已經(jīng)離城，都督印也被他帶走。于是就由吳兆麟、孫武接待，照樣刻了一個印蓋在協(xié)定上，停戰(zhàn)就這樣生效了。從這次停戰(zhàn)三日開始，就導致了以后的議和。
停戰(zhàn)議和本來是袁世凱為瓦解革命力量、竊取政權(quán)而設下的一個圈套。這一點，革命黨人在當時也是有所警覺的。11月間，軍政府以黎元洪名義給袁世凱的一封復信中就曾揭露他：“佯持中立，于漢滿兩面，若皆無所為”,實際上是“欲收漁人之利”;“屢出甘言，思以詐術(shù)，懈我軍心”^[4]。但是結(jié)果還是鉆進了這個圈套。這是因為，漢陽失陷后革命黨人已呈渙散狀態(tài)，他們感到自己軟弱無力；同時，由于缺乏一個徹底的革命綱領(lǐng)，使許多人對袁世凱抱著很大的幻想，認為只要袁世凱能夠接受民國的旗號，革命就能大功告成。這樣，他們就從要求袁世凱“反戈”,到接受袁世凱的停戰(zhàn)條件，進而談判議和，一步步邁向妥協(xié)的道路。
黎元洪在出逃途中，聽到已簽訂了停戰(zhàn)協(xié)定，喜出望外，第二天就從王家店動身回到武昌?？偙O(jiān)察劉公和軍務部副長張振武，因黎元洪事先不同革命同志商量，擅自棄城出走，造成混亂局面，主張通電彈劾他的失職行為，但被其他人所勸阻。通電沒有發(fā)出，黎元洪對革命黨人卻懷恨在心。
停戰(zhàn)原定到12月5日期滿，期滿那天，仍由英領(lǐng)事從中斡旋，繼續(xù)停戰(zhàn)三日。到9日，英領(lǐng)事又轉(zhuǎn)來清軍關(guān)于停戰(zhàn)十五天的條件。黎元洪把停戰(zhàn)條件提交當時正在漢口英租界開會的各省代表討論，議決停戰(zhàn)從12月9日起到12月24日止，停戰(zhàn)范圍除秦、晉、蜀三省另議外，擴大到全國各省，由獨立各省派代表與袁世凱派的代表進行談判。若于十五日談判不決，再延長十五日。同時，黎元洪將停戰(zhàn)條件分別電告各省都督，一律遵守。
槍炮聲靜寂了，湖北軍政府內(nèi)部的斗爭卻愈演愈烈。在漢陽失守后，武昌遭到炮擊期間，四散逃走的一些反動勢力，又紛紛回到武昌，結(jié)集在黎元洪的周圍，用明槍暗箭、挑撥離間、造謠誹謗等種種陰謀手段，向革命力量發(fā)動進攻，全面地篡奪權(quán)力。
這時，經(jīng)各省代表決議，湖北軍政府已被認為是中央軍政府，黎元洪以大都督名義執(zhí)行中央政務。通過與袁世凱停戰(zhàn)議和，黎元洪又從中撈到了資本，他儼然以各省民軍的首領(lǐng)、未來中央政府的領(lǐng)袖自居，湖北革命黨人已完全不在他的眼下了。黎元洪積極培植他的親信勢力。都督府的秘書室，在革命黨人任主任的時候，只是蓋蓋章、收收公文而已。在黎元洪任大都督后，就擴大秘書室組織，任命自己的心腹饒漢祥為秘書主任。規(guī)定“主任秘書承都督之命，參贊中央軍政府一切政務”,權(quán)力大得驚人。秘書室成為黎元洪控制一切的特殊機構(gòu)。
接著，黎元洪就開始一系列排擠打擊革命黨人的陰謀活動。被首先開刀的就是護理總司令、文學社首領(lǐng)蔣翊武。黎元洪利用革命黨人之間的矛盾，首先鼓動一些人舉譚人鳳為“武昌防御使兼北伐招討使，節(jié)制武昌各軍并各省援軍”^[5]。而撤銷戰(zhàn)時總司令一職，調(diào)蔣翊武為都督府高等顧問。這是一個沒有實權(quán)的閑差。譚人鳳是老革命，又是蔣翊武的湖南同鄉(xiāng)，蔣翊武心里雖有意見，也不便反對。譚人鳳志大才疏，又不懂軍事，遭到許多人反對。于是，黎元洪又改派譚人鳳為赴滬參加各省代表會的代表，并下令恢復總司令一職，調(diào)他的親信吳兆麟擔任。吳就職后，改組司令部，以吳元澤為參謀長，周定原為副官長，李明為秘書主任，陶俊為軍法處長。
在黎元洪等人的操縱和離間之下，革命黨人內(nèi)部的派別矛盾迅速尖銳起來。有的黨人如孫武之流更是恃功自傲、權(quán)迷心竅，積極投靠黎元洪。于是，黎元洪利用孫武來約束黨人，孫武借黎元洪的權(quán)勢壓制黨人。黎元洪派蔣翊武任江漢招撫使，給了他一筆錢作為招撫之用。孫武就誣告說，蔣翊武把錢都用作購買槍械，擴充私人武力。黎元洪就派稽查隊，半夜三更到蔣翊武家進行查抄。共進會與文學社的矛盾也就表面化了。
黎元洪、孫武一幫人的倒行逆施，不但激起了文學社社員的不滿，也激起了共進會下層群眾的不滿。許多人就醞釀“二次革命”。到1912年2月28日，終于爆發(fā)了“群英會暴動”。暴動的組織者是共進會會員黃申薌和以前合并于共進會的小團體群英會首領(lǐng)向海潛等人。他們得到文學社社員的支持，就以群英會為號召，聯(lián)合了武昌教導團、畢血會、將校補充團、義勇團、學生軍和武昌城內(nèi)的駐軍共幾千人。由向海潛首先開槍，包圍都督府、軍務部和孫武住宅。暴動者的內(nèi)部意見很分歧，有的主張推倒黎元洪和軍政府，有的主張推倒軍務、內(nèi)務和理財三部，有的主張只推倒孫武。黎元洪對醞釀暴動早有所聞。他與孫武雖然互相利用，但他對孫武的跋扈，也感到似背上芒刺。因此他就借此機會竭力把矛頭引向?qū)O武，放出空氣說：“我這個都督是給堯卿(即孫武)做的?！币馑际撬皇莻€傀儡而已。結(jié)果暴動就成了倒孫武的活動。掛“群英會”、“畢血會”布條的士兵控制了全城，孫武、鄧玉麟等人逃奔漢口。
暴動成了革命黨內(nèi)部的斗爭，黎元洪就從中漁利。他一面表示接受暴動者的要求，將孫武撤職，并借名整理機構(gòu)，改部為司，將所有和孫武接近的部長如蘇成章、牟鴻勛、周之翰等全部撤免。另一方面又把暴動諉罪于文學社，斬殺數(shù)十人，暴尸示眾，進行血腥鎮(zhèn)壓。
黎元洪兩面三刀的戰(zhàn)術(shù)，大大削弱了革命黨人的力量。自群英會暴動失敗后，湖北軍政府就完全控制在以黎元洪為首的反動勢力手中。