元代修鑿?fù)瓿杀逼鸫蠖肌⒛线_(dá)杭州，溝通海河、黃河、淮河、長(zhǎng)江和錢塘江五大流域的大運(yùn)河，全長(zhǎng)3000多里。元滅南宋后，仍依靠舊運(yùn)河進(jìn)行水陸轉(zhuǎn)運(yùn)，先由長(zhǎng)江輾轉(zhuǎn)入淮河，逆黃河而上達(dá)中灤旱站(今河南封丘西南、黃河北岸),陸運(yùn)180里至淇門(今河南浚縣西南),入御河(今衛(wèi)河),再船運(yùn)至大都。如此漕運(yùn)，諸多不便。久不通暢的運(yùn)河舊道，先后被陸續(xù)修鑿：①開通濟(jì)州河。始鑿于至元十三年(1276)一月。至元十八年至二十年，由奧魯赤主持引汶水、泗水，從濟(jì)州(今山東、濟(jì)寧市)西北到須城安山(今山東東平西南)開鑿一條150多里的濟(jì)州河。漕路由淮河入泗水(今中運(yùn)河),經(jīng)濟(jì)州河北達(dá)安山，出大清河(今黃河下游),經(jīng)東阿(今山東東阿南)、利津入海，然后由海運(yùn)入大直沽(今天津市大沽口)達(dá)大都。至此南北航運(yùn)大致溝通。后因?？谟偕秤喝\(yùn)道不通，又改由東阿陸運(yùn)至臨清(今山東臨清南)入御河。②開辟會(huì)通河。至元二十年，派李處巽主持開鑿會(huì)通河，從安山的西南起，分梁山濼(即梁山泊，在今山東梁山、惲城等縣間)的水源北流。經(jīng)壽張西北到東昌(今山東聊城),又西北到臨清入御河。全長(zhǎng)250里，歷時(shí)六個(gè)月完成。中建壩閘引處。至此南北航線已全線溝通。此前黃河奪淮入海，北面故道久已減弱，會(huì)通河開鑿后，黃河部分水流由此入御河，北流入海，因此御河有“北黃河”之稱。③開辟通惠河。中統(tǒng)二年(1261),郭守敬曾上水利條陳六條，提出解決漕運(yùn)直接進(jìn)入大都的問題。至元二十八年(1291)郭守敬主持開鑿?fù)ɑ莺?，引一畝、玉泉山諸水(今北京昌平縣境)至大都西門入城內(nèi)，匯為積水潭(亦名海子),再東南出文明門(今崇文門)至通州高麗莊入白河。全長(zhǎng)164里，置壩閘21座。隔年河成，這樣漕船可一直開進(jìn)大都城內(nèi)。④整治通州運(yùn)糧河。通州南下至白河北運(yùn)河北段一段，上接通惠河，下通大沽，由于水源不足，河道淺澀，影響漕運(yùn)。至元三十年，忽必烈采納漕運(yùn)使司的建議，引小渠水入榆河，增加流量，便利行舟。⑤疏浚揚(yáng)州運(yùn)河與鎮(zhèn)江運(yùn)河。揚(yáng)州運(yùn)河相當(dāng)于舊邗溝，因年久失修，逐漸壅塞。延祐四年(1317)始疏浚暢通。鎮(zhèn)江運(yùn)河屬江南運(yùn)河，至治年間(1321—1323)疏鑿，河面加闊至五丈，底闊三丈，深六尺，長(zhǎng)131里。從鎮(zhèn)江達(dá)常州武進(jìn)縣呂城壩(今江蘇丹陽(yáng)東南)。同時(shí)又開浚了鎮(zhèn)江運(yùn)河的重要水源練湖(今江蘇丹陽(yáng)北)。元代大運(yùn)河的溝通，對(duì)漕糧北運(yùn)、南北物資交流和農(nóng)田灌溉都起了積極作用。