孫中山一意在南方三省發(fā)動(dòng)起義，引起了同盟會(huì)內(nèi)部相當(dāng)普遍的不滿，說是“只注意廣東，對(duì)于長(zhǎng)江各省一點(diǎn)也不注重。華僑所捐的錢也只用到廣東方面去，別處的活動(dòng)一個(gè)錢都不肯給”^[1]。1910年2月，廣州新軍起義失敗，譚人鳳回到東京。這時(shí)，東京同盟會(huì)員不少已灰心失望，無人過問會(huì)事。宋教仁自1907年遼東歸來后，經(jīng)常郁郁不樂，喝醉了酒就臥地長(zhǎng)歌，后來更準(zhǔn)備遁跡隱居。6月10日，孫中山自檀香山秘密前來日本。不久，趙聲、黃興繼至。譚人鳳要求孫中山改良會(huì)務(wù)，孫中山表示同意。其后，宋教仁往談，孫中山因?qū)λ我欢戎С终卤搿⑻粘烧虏粷M，憤憤地說：“同盟會(huì)已取消矣，有力者盡可獨(dú)樹一幟?！彼螁柟剩瑢O說：“黨員攻擊總理，無總理安有同盟會(huì)？經(jīng)費(fèi)由我籌集，黨員無過問之權(quán)，何得執(zhí)以抨擊？”^[2]次日，宋、譚同往，譚人鳳反駁孫中山說：“同盟會(huì)由全國(guó)志士結(jié)合組織，何得一人言取消？總理無處罰黨員之規(guī)條，陶成章所持理由，東京亦無人附和，何得怪黨人？款項(xiàng)即系直接運(yùn)動(dòng)，然用公家名義籌來，有所開銷，應(yīng)使全體與知，何云不得過問？”孫中山表示，可容日約各分會(huì)長(zhǎng)再議^[3]。因日本政府只允許孫中山作短暫停留，24日，孫中山匆匆離去，沒有通知譚人鳳等。由是，譚人鳳也對(duì)孫中山不滿，便和趙聲等商量改組，主張以長(zhǎng)江流域?yàn)檫M(jìn)行地點(diǎn)。趙聲非常贊同，便約集張懋隆、林文、李肇甫、陳勤宣、周瑟鏗、鄒永成、劉承烈、張斗樞等會(huì)議。
會(huì)上，宋教仁提出上、中、下三策，他說：“在邊地進(jìn)行為下策，在長(zhǎng)江流域進(jìn)行為中策，在首都和北方進(jìn)行為上策?！苯?jīng)公議，認(rèn)為“下策太不濟(jì)事，上策太不容易，我們還是以取中策為好?！?sup>[4]于是，決議組織中部同盟會(huì)。
方針既定，但缺乏經(jīng)費(fèi)。宋教仁采納鄒代藩的建議，準(zhǔn)備把新化的銻礦專賣權(quán)出售給日本，公推張斗樞、鄒永成回國(guó)在漢口俄租界寶善里組織廣惠礦務(wù)公司。同時(shí)，譚人鳳南下香港和黃興等協(xié)商。黃興別無意見，只說須有款項(xiàng)方可。胡漢民則表示反對(duì)。譚人鳳怒極，幾乎要給胡一拳，憤然說：“本部在東京，總理西南無定蹤，從未過問?？傆诤斡?？理于何有？東京經(jīng)費(fèi)純仗同志攤派維持，并未向各處招搖撞騙。汝等以同盟會(huì)名義，掣騙華僑巨款，設(shè)一事務(wù)所，住幾個(gè)閑散人，辦一機(jī)關(guān)報(bào)，吹幾句牛皮，遂算本事沖天，而敢藐視一切耶？”^[5]其時(shí)，趙聲已先期返港，勸譚說：“各行其是，理他何為？”次日，譚人鳳邀請(qǐng)趙聲、胡漢民共飲，以一杯敬趙聲說：“愿為國(guó)自愛，毋過激過郁。”以一杯敬胡漢民說：“勸君放開眼界，天下事斷非珠江流域所能成。余往返香港三四次矣，請(qǐng)從此別！”^[6]當(dāng)夜譚人鳳即離港返日。
一個(gè)革命組織必須既有充分的民主，又有正確的集中，才能有戰(zhàn)斗力。同盟會(huì)內(nèi)部在起義地區(qū)上的分歧本是正常的，但是，由于既缺乏民主，又缺乏集中，不能有效地統(tǒng)一意見，因此，分歧愈來愈大。
譚人鳳返日后，日夜奔走，經(jīng)費(fèi)仍無著落，改組事因而擱淺，僅每周組織談話會(huì)一次。同年冬，宋教仁回到上海，參加《民立報(bào)》編輯工作。
“三二九”之役失敗后，在港的同盟會(huì)機(jī)關(guān)很不景氣。趙聲病死，黃興專意準(zhǔn)備暗殺，閉門謝客，沒有人出面處理善后，引導(dǎo)大家前進(jìn)。譚人鳳目睹這些情況，心灰意冷，決志歸家。6月初，路過漢口，焦達(dá)峰、孫武等正在會(huì)商，擬乘湖南鐵路風(fēng)潮暴動(dòng)。焦達(dá)峰勸譚說：“事在人為，何可拋棄前功？”譚接受了焦的意見。次日，孫武邀蔡濟(jì)民、鄧玉麟等共進(jìn)會(huì)干部和譚人鳳見面。譚勸孫武等和文學(xué)社和衷共濟(jì)，相輔而行。過了幾天，譚人鳳東下上海，與宋教仁、陳其美計(jì)議組織同盟會(huì)中部總會(huì)。
7月31日，宋教仁、陳其美、范光啟、姚志強(qiáng)、呂志伊、譚人鳳、章梓、陳勒生等于上海北四川路湖北小學(xué)召開成立會(huì)。到會(huì)二十九人。計(jì)湖南籍七人，浙江籍七人，四川籍四人，福建籍五人，江蘇籍三人，安徽籍二人，云南籍一人。會(huì)議選舉陳其美掌庶務(wù)，潘祖彝掌財(cái)務(wù)，宋教仁掌文事，譚人鳳掌交通，楊譜生掌會(huì)計(jì)。會(huì)議還通過了由宋教仁、譚人鳳分別起草的《中國(guó)同盟會(huì)中部總會(huì)章程》和《宣言》?！墩鲁獭繁憩F(xiàn)了對(duì)原同盟會(huì)進(jìn)行改組和改造的傾向。聲稱：“本會(huì)由中國(guó)同盟會(huì)會(huì)員之表同意者組織而成”,“凡中國(guó)同盟會(huì)會(huì)員依本會(huì)法律入會(huì)者，皆為本會(huì)會(huì)員”。它和共進(jìn)會(huì)一樣拋棄了“平均地權(quán)”的綱領(lǐng)，聲稱“以推覆清政府，建設(shè)民主的立憲政體為主義”。此外，它并特別規(guī)定：“會(huì)員皆一律平等。”^[7]《宣言》試圖對(duì)同盟會(huì)以往的失敗作出總結(jié)，認(rèn)為其原因在于“有共同之宗旨，無共同之計(jì)劃；有切實(shí)之人才，無切實(shí)之組織”。它聲稱“奉東京本部為主體，認(rèn)南部分會(huì)為友邦”,總機(jī)關(guān)設(shè)于上海，各省設(shè)分部，總理一職，則虛位待賢。同時(shí)它也看出了同盟會(huì)組織的某些弊病，表示要在機(jī)關(guān)內(nèi)部實(shí)行“合議”制，防止“專制”獨(dú)斷，要求加強(qiáng)團(tuán)結(jié)，消除“省界”觀念。在起義策略上，它批評(píng)同盟會(huì)以往的做法是“惟挾金錢主義，臨時(shí)召慕烏合之眾，攙雜黨中，冀僥幸以成事”,表示要“培元?dú)猓B(yǎng)實(shí)力”,不輕于發(fā)難^[8]。8月2日，開第二次會(huì)，推譚人鳳為總務(wù)會(huì)議長(zhǎng)。不久，各省分會(huì)相繼成立。南京由鄭贊丞、章梓主持，安徽由范光啟主持，湖北由居正主持，湖南由曾杰、焦達(dá)峰主持。
為了使各地革命黨人不致急躁從事，中部總會(huì)定“宣統(tǒng)五年”(1913)為大舉時(shí)期。
在東京同盟會(huì)總部長(zhǎng)期渙散的情況下，中部總會(huì)的成立，客觀上適合了革命形勢(shì)的需要。當(dāng)時(shí)，長(zhǎng)江流域的革命形勢(shì)正在高漲，中部總會(huì)確定在這一地區(qū)發(fā)動(dòng)是完全正確的，雖然它并沒有看到革命大風(fēng)暴已經(jīng)近在眼前。