和孫中山、黃興注意經(jīng)營(yíng)南方不同，宋教仁注意經(jīng)營(yíng)東北。
還在《二十世紀(jì)之支那》創(chuàng)刊時(shí)，宋教仁就曾特撰《二十世紀(jì)之梁山泊》一文，鼓勵(lì)東北綠林武裝——“馬賊”抗俄反滿。為了與“馬賊”這一輕蔑性的舊稱相區(qū)別，宋教仁稱之為“馬俠”。1906年9月，黃興自廣西、南洋、香港等地活動(dòng)后回到東京，宋教仁擔(dān)心他“冒險(xiǎn)心、激進(jìn)心太甚”,“將來恐有孤注之勢(shì)”,特別提出了經(jīng)營(yíng)東北的設(shè)想^[1]。1907年2月，日人末永節(jié)、古河(古川清)訪問宋教仁，詳細(xì)談到了“馬俠”的有關(guān)情況。宋教仁認(rèn)為，如能約得“馬俠”共同起事，則易于搖撼清廷根基，便和孫中山商量，孫中山表示贊同^[2]。當(dāng)時(shí)正值萍、瀏、醴新敗之余，黃興也希望能開辟出一個(gè)新地區(qū)來，便邀約宋教仁、張繼、末永節(jié)、古河等商談，決定派人赴東北運(yùn)動(dòng)。
3月23日，宋教仁與古河自東京啟程，至門司與白逾桓會(huì)合，渡過鴨綠江，于4月1日抵達(dá)安東。3日，以中國(guó)同盟會(huì)孫文、黃興名義致書大孤山馬俠李逢春等^[3],肯定其“扶弱抑強(qiáng)、抗官濟(jì)民”的志氣，鼓勵(lì)他們集合遼河?xùn)|西、黑水南北的義軍合為一團(tuán)。信中著重分析了“西渡山海關(guān)則永乎不守，南出喜峰口則北京告?！钡挠欣麘?zhàn)略位置，表示說：
仆等向在南方經(jīng)營(yíng)大業(yè)，號(hào)召黨徒已不下數(shù)十萬眾，欲扶義興師久矣。而山川隔絕，去京絕遠(yuǎn)，欲為割據(jù)之事則易，欲制清廷之死命則難；視公等所處之地，形勢(shì)不及遠(yuǎn)矣。欲與公等通好，南北交攻，共圖大舉……^[4]
“欲為割據(jù)之事則易，欲制清廷之死命則難”,這里，實(shí)際上是對(duì)孫中山的戰(zhàn)略思想提出了批評(píng)意見。4月8日，李逢春邀宋教仁上山面談，表示贊成同盟會(huì)宗旨，愿一致行動(dòng)。于是，宋教仁即組織同盟會(huì)遼東支部，主要負(fù)責(zé)人為吳祿貞、藍(lán)天蔚、張紹曾及張榕等。其后，宋教仁曾至北滿聯(lián)絡(luò)著名的綠林首領(lǐng)劉單子，又曾深入長(zhǎng)白山延吉地區(qū)聯(lián)絡(luò)當(dāng)?shù)匚溲b首領(lǐng)韓登舉。
6月，得到惠州起義消息，宋教仁即擬發(fā)兵響應(yīng)，先占遼沈，再逼榆關(guān)，進(jìn)窺北京。不料，清政府早已得悉有關(guān)情況，電令東北各省防范^[5]。白逾桓在堿廠招兵，被清督趙爾巽擊??；潛入沈陽舉事，又被徐世昌所捕^[6]。在這種情況下，宋教仁見形勢(shì)不利，又因同盟會(huì)內(nèi)部矛盾爆發(fā)，張繼打電報(bào)要宋教仁返日，于是，宋教仁便改裝回到東京^[7]。
在北方或首都發(fā)動(dòng)是宋教仁戰(zhàn)略思想中的所謂上策，運(yùn)動(dòng)“馬俠”之役失敗后，仍然有一些革命黨人在北方地區(qū)活動(dòng)，但宋教仁等的注意力則逐漸轉(zhuǎn)向中部地區(qū)。