經(jīng)過了1903年至1904年的初次辯論，康有為、梁啟超的改良主義思想受到了一次沖擊。但是，在海外華僑和國內(nèi)資產(chǎn)階級、小資產(chǎn)階級群眾中，特別是在輿論界、思想界，改良派及其宣傳工具《新民叢報》仍然擁有相當(dāng)大的影響，銷售量達一萬四千余份之多。為了進一步廓清?；识狙?，傳播革命思想，迫切需要創(chuàng)辦刊物，繼續(xù)展開論戰(zhàn)。
在同盟會成立會上，黃興即提議以《二十世紀(jì)之支那》作為機關(guān)報，得到一致贊同。不久，因第二期有《日本政客之經(jīng)營中國談》一文，日本政府禁止該刊發(fā)賣。為避免干涉，同盟會決定另辦《民報》。1905年11月26日，《民報》正式出版。在《發(fā)刊詞》中，孫中山首次公開提出了“民族”、“民權(quán)”、“民生”三大主義，表示希望通過《民報》,使之“輸灌于人心而化為常識”。在《簡章》中，規(guī)定了“本雜志之主義”六條，為：顛復(fù)現(xiàn)今之惡劣政府，建設(shè)共和政體，維持世界真正之平和，土地國有，主張中國、日本兩國之國民的連合，要求世界列國贊助中國之革新事業(yè)等。
《民報》最初的編輯人為胡漢民，主要撰稿人有陳天華、胡漢民、汪精衛(wèi)、朱執(zhí)信等，發(fā)行人為張繼，經(jīng)理為陳天華?！睹駡蟆穭?chuàng)刊不久，反對“取締規(guī)則”的斗爭進入高潮，部分日本報紙對中國留學(xué)生進行冷嘲熱諷，12月7日，《朝日新聞》甚至以“放縱卑劣”四字相攻擊^[1]。8日，陳天華憤而投大森海灣自殺。死前遺書說：“我不自亡，人孰能亡我者？惟留學(xué)而皆放縱卑劣，則中國真亡矣。豈特亡國而已，二十世紀(jì)之后，有‘放縱卑劣’之人種，能存于世乎？鄙人心痛此言，欲我同胞時時勿忘此語，力除此四字，而做此四字之反面，堅忍奉公，力學(xué)愛國?？滞灰娐?，而或忘之，故以身投東海，為諸君之紀(jì)念?！?sup>[2]陳天華的性格有激情奔放的一面，也有其脆弱而不耐磨煉的一面，跳海之舉正是這兩方面性格交織的表現(xiàn)。他的死使《民報》喪失了一個出色的宣傳家。
1906年6月，同盟會派龔煉百、時功玖等迎章炳麟出獄東渡。7月7日，經(jīng)孫毓筠介紹，由孫中山主盟，章炳麟加入同盟會^[3]。15日，東京中國留學(xué)生集會歡迎。到會兩千人。這天下雨，來晚了的人擠不進會場，就站在雨中。會上，章炳麟發(fā)表了長篇演說，認(rèn)為近日辦事的方法，第一要在感情，而要成就這感情，有兩件事最重要：一是用宗教發(fā)起信心，增進國民的道德；一是用國粹激動種性，增進愛國的熱腸。他說：孔教、基督教都不可用，通行的佛教也有許多雜質(zhì)，必須設(shè)法改良。華嚴(yán)宗主張普度眾生，頭目腦髓，都可施舍與人，在道德上，最為有益。法相宗主張萬法唯心，一切有形的色相，無形的法塵，總是幻見幻相，并非實在真有，這在哲學(xué)上今日也最相宜。要有這種信仰，才得勇猛無畏，眾志成城，方可干得事來。他又說：提倡國粹，不是要人尊信孔教，只是要人愛惜我們漢種的歷史，一是語言文字，二是典章制度，三是人物事跡。中國人曉得了這三項，那愛國愛種的心，必定風(fēng)發(fā)泉涌而不可遏抑^[4]。章炳麟是在佛教哲學(xué)和中國傳統(tǒng)文化方面都有精深研究的思想家，他力圖從這兩者中找尋為資產(chǎn)階級民主革命服務(wù)的精神武器。但是，它們畢竟都太陳舊了。佛教的主觀唯心主義造就不出勇猛無畏的革命軍，而那種對“漢種歷史”的籠統(tǒng)推崇也容易流為對封建主義的鼓吹。自第七號起，《民報》由章炳麟主編，上述觀點即成為他的編輯思想，也部分地影響了革命派的文化宣傳活動。當(dāng)時，國學(xué)講習(xí)會、國學(xué)振起社一類組織紛紛建立，講“國學(xué)”成為一種時髦。此后，章炳麟一方面發(fā)表一系列源本經(jīng)史、淵雅古樸的排滿文章，在士大夫階層中發(fā)生了很大影響；同時也發(fā)表不少闡揚佛學(xué)之作，被人譏為不作“民聲”,而作“佛聲”^[5]。
《民報》一創(chuàng)刊就受到廣大讀者歡迎，至第四號。即銷行至萬份，至第七號，又銷行至一萬七千份。它被以各種巧妙而隱蔽的形式運向國內(nèi)，散發(fā)各地。不少號一版、再版、三版仍然不能滿足要求，第一號發(fā)行六版，第二、三號各發(fā)行四版，得到一本的人“如獲拱璧”^[6]。1906年12月2日，《民報》在東京召開周年紀(jì)念會，盛況空前，會場內(nèi)外水泄不通。宋教仁和宮崎寅藏因為晚到，是從窗口爬進去的，宋教仁擠到主席臺時，連鞋子都丟了。會議由黃興主席，章炳麟讀祝詞，孫中山、章炳麟、日人池亨吉、北一輝、萱野長知、宮崎寅藏等先后演說。會議一直在如雷的掌聲、歡呼聲、萬歲聲中進行。其間，有人提議捐助《民報》經(jīng)費，“一時投錢者、書名于冊者，不知若干人”^[7]。會后散發(fā)《民報》臨時增刊《天討》贈書券，共發(fā)出五千枚。這次會議反映出《民報》的巨大影響，也反映出東京中國留學(xué)生日益革命化的趨向。
1907年3月，胡漢民、汪精衛(wèi)隨孫中山離日，《民報》主要撰稿人改為劉師培、黃侃、汪東、陳去病等。同年12月，章炳麟因和孫中山的矛盾日益加深，以腦病為理由辭職，第十九號由張繼編輯。1908年1月，張繼因參加日本無政府主義者的金曜講演會，被日警追捕，輾轉(zhuǎn)逃往法國，自第二十號改由陶成章編輯。陶對理論不感興趣，聲明“專以歷史事實為根據(jù)，以發(fā)揮民族主義，期于激動感情，不入空漠”^[8]。至第二十三號，再歸章炳麟編輯，以湯增璧為副。
1908年10月，由于同盟會所發(fā)動的武裝起義屢遭失敗，湯增璧轉(zhuǎn)而鼓吹暗殺，在《民報》第二十四號上發(fā)表《革命之心理》一文，贊揚“虛無黨”,“欲以陳師鞠旅，化而為潛屠暗刺，并以組合蒞盟，轉(zhuǎn)而為徑情孤往”。適值日本政府由反動的桂太郎組閣，加緊鎮(zhèn)壓日本革命黨人和無政府主義者；又值清政府派唐紹儀為中美聯(lián)盟赴美，道經(jīng)日本，章太炎在《民報》發(fā)表《清美同盟之利病》予以抨擊。于是，唐紹儀便嗾使駐日公使出面交涉，要求封禁《民報》。同月19日，日本政府以發(fā)表《革命之心理》,激揚暗殺為理由，下令禁止第二十四號《民報》發(fā)行。20日，章炳麟向警署提出詰問。次日，致書日本內(nèi)務(wù)大臣平田東助，退還命令書。23日、26日，又連續(xù)致書平田東助，指責(zé)日本政府的錯誤政策，聲稱，“本編輯人兼發(fā)行人寧為玉碎，不為瓦全”,“封禁驅(qū)逐，惟命是聽”^[9]。在宮崎寅藏等支持下，黃興、章炳麟、宋教仁等延聘律師向日本法庭提出訴訟。11月22日開庭時，東京地方裁判廳門前集中了約兩千名激動的中國留學(xué)生，“人聲騷亂，勢甚洶洶”,迫使法庭懸牌延期^[10]。26日第二次開庭時，章炳麟以雄辯家的氣概駁斥了日方所加的罪名。他說：“我買手槍，我蓄刺客，或可謂擾亂治安。一筆一墨，幾句文字，如何擾亂？”又說：“我言革命，我革中國之命，非革貴國之命。我之文字，即鼓動人，即扇惑人，扇惑中國人，非扇惑日本人，鼓動中國人，非鼓動日本人，于貴國之秩序何與？于貴國之治安何與？”^[11]駁得日方啞口無言，竟悍然宣布禁止出版。其后，黃興等決定將《民報》社遷往美國，主張“中美兩國之國民聯(lián)合”^[12],因故未果。
1909年10月，汪精衛(wèi)由南洋到日本復(fù)刊《民報》,偽稱在法國巴黎出版，實則仍在日本印刷，僅刊行兩期。
1911年7月，南洋華僑在五十一個城市募捐，計劃在檳榔嶼重刊《民報》,聘宋教仁、戴季陶為編輯，因武昌起義爆發(fā)而止^[13]。
《民報》與《新民叢報》是論戰(zhàn)的主要對手，在南洋，則在《中興日報》和《南洋總匯新報》之間展開。《總匯報》原是革命派在新加坡的報紙，1905年冬發(fā)刊，由陳楚楠、張永福主持。1906年春，轉(zhuǎn)入改良派之手，改名《南洋總匯新報》。為了與之對抗，革命派于1907年8月20日創(chuàng)辦《中興日報》,由田桐主持。這一時期，清政府“預(yù)備立憲”的鑼鼓已經(jīng)敲響，潦倒在海外的改良派感到了希望，國內(nèi)新出現(xiàn)的立憲派更加興致沖沖，于是，海內(nèi)外呼應(yīng)，共同掀起國會請愿運動。1908年6月，《總匯新報》發(fā)表《立憲為今日救國之唯一手段》一文，以向清政府要求召開國會為最高目的。同月，田桐向《總匯新報》發(fā)出進行“文戰(zhàn)”的通知，黃興、胡漢民、汪精衛(wèi)等紛紛趕來參加，改良派則從美洲請來了其地位僅次于康、梁的徐勤，雙方展開了又一次激烈的論戰(zhàn)。這次論戰(zhàn)內(nèi)容的許多部分和東京相同，不同點是：關(guān)于民生主義的爭辯沉寂了，而“國會”、“立憲”則成為引人注意的新論題。
在其他地區(qū)展開論戰(zhàn)，形成對壘的報紙為：
《自由新報》與《新中國報》(檀香山)
《華暹新報》與《啟南新報》(曼谷)
《光華報》與《商務(wù)報》(仰光)
《大漢日報》與《日新報》(溫哥華)
《美洲少年報》與《世界報》(舊金山)
上述地區(qū)論戰(zhàn)的激烈程度也不亞于東京和南洋。據(jù)有關(guān)記載，由1907年至1911年的四五年內(nèi)，檀香山的《自由新報》幾乎無日不與《新中國報》展開辯論，往往因報上一字一句之微涉訟法庭；《大漢日報》和《日新報》之間的駁論竟發(fā)展至二百余續(xù)，形成馬拉松式的筆戰(zhàn)。
論戰(zhàn)主要環(huán)繞著三民主義進行?！睹駡蟆菲陂g，孫中山曾口授而由汪精衛(wèi)執(zhí)筆寫成《駁革命可以召瓜分說》一文?！吨信d日報》期間，孫中山又親自撰寫《論懼革命召瓜分者乃不識時務(wù)者也》等三篇文章。他領(lǐng)導(dǎo)了對改良派的論戰(zhàn)，取得了勝利，是這一斗爭的旗幟。