明成化元年(公元1465年),廣西瑤、僮等少數(shù)民族流民剽掠廣東，所過郡邑均遭破壞。朝廷拜都督趙輔為總兵官。兵部尚書王竑說：“韓雍才氣無雙，平賊非雍莫可?！庇谑歉娜雾n雍為左僉都御史，贊理軍務(wù)。
當(dāng)時(shí)，朝中有人建議，對(duì)在廣東的流寇應(yīng)當(dāng)驅(qū)趕，對(duì)在廣西的流寇應(yīng)當(dāng)圍困，重兵駐在大藤峽(在今廣西桂平西北60里),扼其出入，蹂其禾稼，堅(jiān)持一二年，流寇自然消滅。韓雍對(duì)此有異議，認(rèn)為流寇已蔓延數(shù)千里，如果一遇到就交鋒，是自取失敗。應(yīng)當(dāng)集中兵力直搗大藤峽。這樣，南可援高、肇、雷、廉，東可應(yīng)南、韶，西可取柳、慶，北可斷陽峒諸路。首尾相應(yīng)，攻其腹心，巢穴既傾，其余便迎刃而解。舍此不圖，而分兵四出，致使流寇愈加?xùn)|奔西突，郡邑也愈加殘破，這種辦法如同一邊救火一邊吹風(fēng)，后果決不會(huì)好。一番建議，說得眾臣連連稱善。都督趙輔素知韓雍才略過人，所以軍謀一概聽從其言。
朝廷軍隊(duì)日夜兼程，趨進(jìn)潯州(治所在今廣西桂平),延問當(dāng)?shù)馗咐希颊f大藤峽天險(xiǎn)難攻，應(yīng)當(dāng)用計(jì)圍困。韓雍認(rèn)為，峽廣600余里，怎么圍困？分兵則力量減弱，曠日持久則糧草不繼，照此下去何日才能平定流寇！ 于是決計(jì)集中兵力進(jìn)攻。兵至峽口，見儒生、里老數(shù)十人跪伏道旁，表示愿為向?qū)?。韓雍上前大聲喝斥：“賊寇敢欺騙我！”命令左右將他們立即斬首。左右皆驚愕不解。等到捆綁搜身，果然發(fā)現(xiàn)他們每人袖中藏有利刃。隨即全部斬首示眾。峽中流寇大驚說：“韓公天神也?！?br>韓雍令總兵官歐信率軍攻其北，自己與都督趙輔率軍攻其南，又令參將孫震從水路進(jìn)攻，并分兵嚴(yán)守各隘口?？苁缀畲蠊反髴?，但仍立柵南山，多置滾木、壘石、鏢槍、藥弩抗拒官軍。韓雍督諸軍水路并進(jìn)，登山與流寇殊死作戰(zhàn)，連破石門、林峒、沙田、古營諸巢穴，直抵橫石塘及九層樓諸山。流寇又立柵數(shù)重。憑高以拒、官軍佯攻誘其發(fā)矢石，估計(jì)他們矢石發(fā)盡，韓雍急命將士緣木攀藤而上，又另遣壯士從間道先登，在山頂發(fā)炮，流寇終不能支，全部敗潰。這次戰(zhàn)斗先后破除324寨，生擒寇首侯大狗及其黨780人，斬首3200多人，墜溺死者不計(jì)其數(shù)。峽原有大藤如彩虹橫亙兩崖之間，韓雍用大斧砍斷，并改名斷藤峽，勒石紀(jì)功而還?；实勐勴n雍平寇成功，賜敕嘉勞，升韓雍為左副都御史，提督兩廣軍務(wù)。