清乾隆五十二年(公元1787年),林爽文在臺灣領導農(nóng)民起義?？偠嚼钍虉蚋案＝ㄖ卫碥妱?，邀趙翼和他同行。當時，總兵柴大紀駐守鹿耳門(在今臺灣南安平港北)已有半年多。他向朝廷上奏說，起義軍殺死了他的兒子，并將尸首劈成了幾塊。老百姓的生命安全也都得不到保障?；噬下犝f此事，也被打動了，頒下詔書，要柴大紀派兵護送百姓內(nèi)渡到大陸來。
李侍堯把皇上下旨撤軍的事告訴了趙翼，趙翼說：“柴總兵早就想撤回大陸了，只是懼怕國法而不敢擅自行動罷了?，F(xiàn)在他一放棄這座城，那么鹿耳門很快就會被起義軍占領，整個臺灣也就全完了！ 即使以后派大軍收復臺灣，但已是無路可人了。依我看，應先把圣旨扣壓下來，再上奏朝廷，讓皇上收回成命。”李侍堯明白了趙翼的意思，便扣下了圣旨。正巧第二天就接到了皇帝的第二道圣旨，要追回先前所下的圣旨。李侍堯因此受到了嘉獎。
不久，大將軍福康安率領大軍前來平叛，很順利地由鹿耳門進軍臺灣，鎮(zhèn)壓了農(nóng)民起義。這都是因為當初聽從了趙翼的計策。