宋子文出任財政部長之后，加緊改革海關行政制度和關稅制訂政策，為收回國家主權，發(fā)展經(jīng)濟和貿易，增加財政收入，而不懈努力。
宋子文十分了解外國人把持中國海關主權對中國的危害性。他指出：“吾國關稅，受協(xié)定之拘束，妨害稅收，損失主權，至堪痛惜。”^[1]在關政方面，他曾談到，“國民政府遷到南京之時，政府和公眾對于海關都嘖有煩言，諸多不滿。人們指責海關已成為國中之國，是使館街(指北京東交民巷——引者)的走卒；總稅務司的話成為國家財政上的法律，總稅務司還充當主宰北京每一任財政總長的后臺老板角色；關稅稅款掃數(shù)存入外國銀行，這只為外國銀行增加了信用，而中國的銀行則被撇在一邊；海關所有高級職位全為洋人獨占，中國人沾不到邊?！?sup>[2]他認為我國關稅由外人主持，頗有尾大不掉之勢，因此，“對于海關一切行政，決擬徹底改革”^[3]。改革的具體措施是：
(一)撤換擅權抗命的外籍稅務司。1928年1月，財政部獲知蕪湖海關英籍稅務司賈士(Gards)違背命令，擅放鹽斤，并借故恫嚇封關，宋認為這是“蔑視政府，濫用職權”,立即決定將賈士撤掉，另委西班牙人馬悌(Macti)繼任。另一方面訓令其他各關稅務司：“如有不遵政府命令，越權瀆職情事，本部職權所在，決當嚴予懲處，不稍寬縱。”^[4]
(二)審查各海關稅務司支用經(jīng)費情況。在關政方面，各海關名義上受轄于財政部，但支出經(jīng)費情況從來不向財政部匯報送審。宋為了“慎重關款”及為關稅自主作準備，通令各海關稅務司須將支出費用分別款目，按期造送表冊，以便財政部審查、考核。
(三)嚴格稽核各關征稅情況。宋子文命令海關各關、局將連年實收實解款額查明具報，在此基礎上確定各關局的稅收比率，作為今后考核的標準。此外，為防止紕漏，決定改變以往不查驗稅單的狀況，命令各局須將所有稅單之副單按期造冊，呈送財政部關務署^[5]。
(四)改變以往海關行政習用英文英語的狀況。宋認為，海關行政中只使用英文英語，“不足以重體制而便商民”,遂通令各海關稅務司，嗣后所有海關應用單照，發(fā)布文告，以及批示商人之文件，統(tǒng)應一律以中文為主^[6]。
(五)對總稅務司的工作進行監(jiān)督，直至撤換。南京政府成立時，海關總稅務司一職由易紈士(Edwards)代理。易在任廣州海關稅務司期間，對政府不甚友好。宋子文在出任財長之初，曾與易紈士協(xié)商由關余中提出部分款額，未果。宋還希望易紈士在中國爭取關稅自主一事中發(fā)揮積極作用，亦遭拒絕。在國民革命軍攻占天津之后，易紈士仍持不合作態(tài)度。宋子文對易非常不滿。他訓令易紈士，“自本年(1928年)1月份起，將逐月收支數(shù)目，及還本付息數(shù)，每項匯兌率并結存各款數(shù)，存何銀行，分別列表造冊具報，以憑稽核”^[7]。又令易紈士：由海關收入項下?lián)芨陡鳈C關的經(jīng)費，須按月將所撥款匯解財政部關務署^[8]。采取上述措施后，總稅務司的工作就置于財政部較有效的控制之下。宋并在1929年1月任命梅樂和(Maze)為海關總稅務司，取代了易紈士。
(六)改變海關職員洋人占絕對優(yōu)勢的局面。宋子文認為海關職員洋人占絕對優(yōu)勢是由歷史原因造成的不合理狀況，應立即著手改變。1929年初，宋指示有關人員組織了海關章制審查委員會。經(jīng)研究決定停止招洋人關員，并提高華人關員的地位和待遇，為華人自辦海關作準備^[9]。財政部還主持開辦稅務專門學校，限制海關方面自行招考關員，逐漸使新關員全由該校學生充任。宋還規(guī)定，海關用人“應盡華員升充”^[10];“聘雇海關洋員，僅限于技術方面，并須得財長之特許”^[11]。這就打破了延續(xù)五十多年的舊例，開始提升華員出任稅務司一職。以后，出任代理稅務司、副稅務司、代理副稅務司的華員，不乏其人。這就為中國人獨立自主征收關稅，稽查走私創(chuàng)造了一定的條件。