房山縣西北部山岳地帶自隋唐以來(lái)就是佛教勝地，上方山兜率寺、六聘山天開(kāi)寺、云蒙山龍泉寺等都留有佛教許多遺跡遺物，石經(jīng)山云居寺則是其中最著名者，有“北京敦煌”之美稱(chēng)。
傳說(shuō)云居寺是因靜琬大師繼承師傅遺愿，刻石藏經(jīng)，終于感動(dòng)了天地，才得以建成的?！兜劬┚拔锫浴酚休d：房山縣西南四十里，有山好著白云，腰其豐麓，曰白帶山。所生芯題草，他山實(shí)無(wú)。曰芯題山。石經(jīng)者，千年矣，始曰石經(jīng)山，至今也，亦曰小西天云。北齊南岳慧思大師，慮東土藏教有毀滅時(shí)，發(fā)愿刻石藏，閟封巖壑中，以度人劫。岳坐下靜琬法師，承師傅囑，自隋大業(yè)，迄唐貞觀，大涅槃經(jīng)成。其夜，山為三吼，為生香樹(shù)三十余。六月水漲，為浮大木千統(tǒng)，至山下，構(gòu)云居寺焉。
云居寺因藏有佛舍利，并且是世界上石刻藏經(jīng)最多的地方之一而名揚(yáng)天下。明萬(wàn)歷二十年(1592),寺內(nèi)達(dá)觀和尚率僧人清理石經(jīng)板，在藏經(jīng)洞發(fā)現(xiàn)隋大業(yè)十二年(616)置放于函內(nèi)的佛舍利三粒，“發(fā)現(xiàn)際，異香發(fā)于函，蓋石、銀、金函三發(fā)，而得小金瓶，舍利現(xiàn)矣。狀黍米，色紫紅”。(《帝京景物略·幾輔名跡》)后將佛舍利放回，“安置故處”。在其他文件上也有此事的記載。1981年，云居寺文物研究所根據(jù)文獻(xiàn)記載，終于找到了佛寶舍利子，卻只有兩粒，另一粒不翼而飛，成為佛寶之謎。
北齊時(shí)南岳慧思大師，擔(dān)心會(huì)發(fā)生毀經(jīng)滅佛的劫難，就決心將經(jīng)刻在石頭上，閉鎖起來(lái)，以傳于后世?；鬯嫉牡茏屿o琬，隋幽州智泉寺僧人，繼師遺志，發(fā)愿刻造石經(jīng)，其弟子光導(dǎo)、僧化、惠暹、玄法四代相繼主持刻經(jīng)，后來(lái)得到金仙公主奏賜經(jīng)本四千多部作為底本，先后刻成經(jīng)書(shū)百余部，并將它們藏于山中。
唐末刻經(jīng)事業(yè)日漸衰敗，“會(huì)昌法難”期間，云居寺也遭打擊，五代時(shí)天下混亂，刻經(jīng)事業(yè)只得停頓。直到遼圣宗太平七年(1027),涿郡刺史韓紹芳對(duì)石經(jīng)驗(yàn)名對(duì)數(shù)，并將云居寺石經(jīng)情況奏聞圣宗，刻經(jīng)事業(yè)才得以繼續(xù)。韓紹芳和云居寺住持續(xù)刻、補(bǔ)刻了九部石經(jīng)。道宗大安九年(1093)名僧通理募化資財(cái)繼續(xù)刻經(jīng)，次年資財(cái)耗盡，被迫中止，共刻成小型經(jīng)板四千零八十塊。通理有計(jì)劃地補(bǔ)刻前人所缺的經(jīng)，從而使大乘經(jīng)、律、論三藏完備。
靜琬及其弟子所刻石經(jīng)藏于九個(gè)藏經(jīng)洞中，八為封閉式，最大一洞雷音洞為開(kāi)放式，洞以四根八棱石柱支撐洞頂，柱上雕佛像一千零五十六尊，俗稱(chēng)千佛柱。洞作不規(guī)則方形，每面10米左右，洞壁嵌有靜琬最初刻的一百四十六塊佛經(jīng)板。遼僧通理去世后，其弟子善銳、善定等人于天慶七年在寺西南角開(kāi)一地穴，將通理和韓紹芳所刻石經(jīng)板一并入穴，在穴上筑塔為標(biāo)志，此即南塔(壓經(jīng)塔)。這是座八角十一層密檐式磚塔，后毀于日軍炮火。
云居寺共有經(jīng)板一萬(wàn)四千二百七十七塊，計(jì)佛經(jīng)九百余部，三千四百五十二卷，遼刻《契丹經(jīng)》實(shí)為國(guó)之重寶。1954年印度總理尼赫魯訪華，曾向周恩來(lái)總理當(dāng)面提出以一兩黃金一斤石頭的價(jià)格買(mǎi)走全部石經(jīng)，被周總理婉言拒絕。